地球上住着很多偷偷隐居的外星人，只有少数人才知道这个真相。主人公 “工藤优幸”就职于一个名叫 “伊吉斯”的民间警备组织，该组织主要是解决外星人引起的纠纷。在优幸的身上隐藏着一个连他自己都不知道的秘密，泰迦奥特曼的光之粒子寄宿在了他的身上，当泰迦奥特曼在优幸体内苏醒的那一刻起，新的故事开始了。

TV系列的幕后黑手托雷基亚败给了泰迦奥特曼，被封印在托雷基亚体内的邪神魔兽格里姆德借机从托雷基亚体内逃出。托雷基亚设计引来了泰迦的父亲泰罗奥特曼，最终托雷基亚阴谋得逞，还让泰罗坠入了黑暗。恶人协会的人似乎盯上了伊吉斯的优幸，新生代的奥特战士们纷纷赶来地球，前来帮忙。一场世纪大战一触即发。

地球因百特星人的突然出现而陷入了濒临灭绝的危机中，人类全都莫名其妙地突然失踪了。地球成为了百特星人的怪兽兵器实验场。但是，仍有极少数的人幸存下来了，那就是对未来充满希望的孩子们。为了孩子们的未来，为了把握明天，7位女性组成了U小队与百特星人对抗。首先来到她们守护的地球的是戴拿奥特曼（飞鸟信），然后是高斯奥特曼（春野武藏）和赛罗奥特曼。大贺希与百特星人捕获的宇宙生命体一起误入这个地球，赛罗奥特曼对他充满勇气的行动产生了共鸣，与他一心同体，但是大贺并不能坦率地接受得到奥特战士力量的事实。百特星人真正的目的是要让最强的怪兽——超级芝顿在这个地球上诞生。最大的危机正在逼近地球！对抗它的是赛罗奥特曼、高斯高特曼、戴拿奥特曼，还有U小队！地球的存亡之战，现在开始！

剑悟变成特利迦奥特曼，为了守护大家的笑容，在永恒核心里消失了。时间推进到特利迦消失的两年后，时冈代理队长率领精英胜利队想方设法复活在永恒核心中消失的真中剑悟。在众人的不懈努力下，终于复活了剑悟。剑悟复活后取回了特利迦的力量，结果在面对新的怪兽时，陷入了苦战。就在特利迦难以招架的时候，泽塔奥特曼跨越宇宙次元，再次来到地球前来帮助特利迦。没想到随着事情的发展，遥辉发现了事情的背后居然浮现出了宿敌赛雷布洛的影子。于是，遥辉开始追查赛雷布洛的踪迹。三千万年前超古代人的残党，他与赛雷布洛联手，试图获取剑悟的光之力量。他可以变身成邪恶特利迦，实力非常强大。特利迦根本招架不住邪恶特利迦，不光泽塔前来帮助特利迦，就连伊格尼斯也变成黑暗特利迦前来协助特利迦。三位战士将联手粉碎超古代人残党与赛雷布洛的阴谋。

跨越时空苏醒的光之巨人特利迦奥特曼，苏醒了！3000万年前，一股黑暗力量使世界陷入恐惧。最后是光之巨人将黑暗封印到了遥远的宇宙中。不过，光之巨人也用尽了自己的力量，在红色星球上陷入了长眠。时光流转，地球和平同盟“TPU”在地球组建了精英小组“精英胜利队”。主人公真中剑悟生活在新开拓的火星上，他有一个梦想，就是守护大家的笑容。剑悟平日里在植物研究中心工作，他是名植物学家。最近他总是重复做一个恶梦，梦里总出现一名神秘的巨人，这让他十分苦恼。有一天，超古代封印的黑暗突然再次来袭，打破了火星安稳宁静的生活。当火星的街道被怪物破坏时，剑悟在命运的引导下，和沉睡的光之巨人相遇了。这次相遇会给他和地球带来怎样的影响呢？

跨越时空苏醒的光之巨人特利迦奥特曼，苏醒了！3000万年前，一股黑暗力量使世界陷入恐惧。最后是光之巨人将黑暗封印到了遥远的宇宙中。不过，光之巨人也用尽了自己的力量，在红色星球上陷入了长眠。时光流转，地球和平同盟“TPU”在地球组建了精英小组“精英胜利队”。主人公真中剑悟生活在新开拓的火星上，他有一个梦想，就是守护大家的笑容。剑悟平日里在植物研究中心工作，他是名植物学家。最近他总是重复做一个恶梦，梦里总出现一名神秘的巨人，这让他十分苦恼。有一天，超古代封印的黑暗突然再次来袭，打破了火星安稳宁静的生活。当火星的街道被怪物破坏时，剑悟在命运的引导下，和沉睡的光之巨人相遇了。这次相遇会给他和地球带来怎样的影响呢？

主角兄弟凑活海和凑勇海、高中生妹妹，以及开精品店的父亲，他们四人共同生活在一起。某日，兄弟两人获得了罗布回旋闪光和罗布水晶，哥哥变身为充满火元素之力的“罗索奥特曼”，弟弟变身为充满水元素之力的“布鲁奥特曼”。这是一部描写兄弟之间争吵磨合、共同成长、挑战强敌的特摄作品，同时也是一部围绕兄弟展开的家庭主题连续剧。

两位特殊部队的队员坐在运输机内，盯着监控的屏幕。突然一声警报响起，系统检测到有怪兽出现。这时候特殊部队队员比留间弦人下达了新的指令，弦人命令所有人按照预案去指定地点集合。一头来自宇宙的怪兽甲壳怪兽从天而降，巨大的冲击力给城市带来了很大的破坏。地面防卫部队与怪兽展开了激烈交战。怪兽的肆意破坏摧毁了很多大楼，怪兽出现的地方化为了一片火海。弦人为了拯救还没有逃出的群众，独自冲入火海救人。弦人在救人过程中出现意外，关键时刻他体内涌现出一道神秘的光。新的奥特曼就此诞生了，新的奥特曼不光救下了弦人队长，还打败了怪兽。地球防卫队日本支部的参谋长宣布成立全新的小队，全称叫特殊怪兽对应分遣队。招揽优秀的战斗人员组成一支精英小队专门处理怪兽。

特利迦奥特曼与黑暗巨人的战斗结束数年之后，地球再次迎来了和平的年代。现在已经基本见不到怪兽的踪影了，怪兽带来的灾害影响也已经渐渐地淡出了人们的视线。人类已经开辟了火星移居地，并打算组建新的队伍开辟第二个火星移居地。地球上的人类开始了探索宇宙的征程，现在进入了新领域时代。结果，在探索的过程中，宇宙神秘生命体斯非亚突然出现在了主人公明日见奏大所在的小队面前。斯菲亚对地球发起了侵略，并断绝地球和宇宙的一切通讯，地球变成了“孤岛行星”。奏大原本在宇宙港送货，结果却遇到了斯菲亚的袭击。奏大为了掩护其他人逃走陷入了死亡。就在此时，新的光出现了！在光的笼罩下，奏大变身成为了德凯奥特曼。获得了变身能力的奏大与新生精英胜利队的队员一起，与斯菲亚展开了新的斗争！

20世纪末，世界各地的天才少年组成了一个名为"炼金之星"的组织，其成员之一的高山我梦作为"XIG"的一员，靠大地给予的红光变身成盖亚·奥特曼后，投入了同CRISIS计算机所预测到的"根源性毁灭招来体"进行的誓死决战中；另一方面，已脱离"炼金之星"的"藤宫博也"坚定地认为：对于地球而言，人类才是真正的癌细胞。他凭着"蓝光"的威力，变身成与"盖亚"相对立的"蓝色奥特曼--阿古茹·奥特曼"。作为日本平成年度奥特曼三作品的压轴戏，盖亚·奥特曼其最大的变化在于"盖亚和阿古茹"这二个敌对、且都为地球人出生的"人类奥特曼"的登场。当然，他俩的战斗场面也属前所未闻。同时，二人的对立观点贯穿前半段，因此前半段贴近于连续剧。